শীর্ষেন্দু মুখোপাধ্যায়ের জন্ম ১৯৩৫ সালের ২রা নভেম্বর, ময়মনসিংহে, যা বর্তমানে বাংলাদেশের অন্তর্গত। তাঁর ছেলেবেলা কেটেছে বিহার, পশ্চিমবঙ্গ ও অসমের বিভন্ন অংশে। তাঁর পিতা রেলওয়েতে চাকরি করতেন । শীর্ষেন্দু কলকাতার ভিক্টোরিয়া কলেজ হতে ইন্টারমিডিয়েট ও কলকাতা বিশ্ববিদ্যালয় হতে বাংলায় মাস্টার্স ডিগ্রী লাভ করেন। শীর্ষেন্দু প্রথম চাকরি নেন স্কুল শিক্ষক হিসাবে। বর্তমানে তিনি আনন্দবাজার পত্রিকার সাথে জড়িত। এছাড়া তিনি দেশ পত্রিকাতেও লিখে থাকেন।